S级忍者通常指代那些能力远超普通上忍、拥有独特血继限界或秘传忍术、在忍界享有极高声誉的角色，他们的强度设定往往与原著中的影级实力或晓组织级别的威胁度挂钩，是玩家在游戏中追求的核心战力目标。这类角色的获取途径多样，包括但不限于高级招募、特定活动兑换、忍者碎片合成以及部分充值或赛季奖励，例如游戏内的S级忍者就包含了自来也、波风水门、宇智波鼬、千手柱间、宇智波斑等标志性人物，他们的上架通常遵循特定的时间周期。理解S级角色的定位是规划游戏策略的第一步，他们不仅是决斗场中的中流砥柱，也是挑战高难度副本和团队玩法的重要保障。
这些S级角色之所以超凡，关键在于其技能机制往往融合了高伤害、大范围、强控制或多段位移中的多项特质，并且与原著能力高度契合。在实战中，他们的技能普遍具有起手能力强、连招稳定性高或拥有独特的无敌与霸体帧等优势。有些忍者的技能具备远程消耗和吸附效果，是优秀的起手手段；而另一些角色则可能拥有灵活的形态切换机制，通过积攒能量点来解锁更强力的追打技能，从而在连招中打出爆发伤害。玩家需要深入理解每个S级忍者的技能细节，包括普攻段数、技能的前摇与后摇、是否具备扫地效果（攻击倒地敌人）以及奥义大招的释放时机与是否可衔接技能，这是发挥其全部潜力的基础。
针对不同的战斗场景，S级忍者的选择与使用策略也需相应调整。在决斗场等PVP环境中，起手能力、机动性和反手能力尤为关键。部分忍者擅长通过空中技能或远程脱手技能进行安全消耗，克制缺乏对空手段的对手；而另一些忍者则凭借高速位移和无敌技能来抢占先机或规避伤害。携带合适的秘卷技能可以极大弥补忍者自身的短板或强化其优势，例如搭配控制型秘卷来稳定起手连招，或选择霸体类秘卷来应对敌方的先手压制。掌握替身术的释放时机也至关重要，通常建议在对方连招造成一定伤害或使用关键技能后使用，以换取反击空间，而非一受击就立即使用。
有效的资源管理与长期培养是持续拥有并强化S级角色的保障。对于新玩家而言，初期资源有限，应集中金币、体力等资源优先培养1至2个核心的S级输出角色，避免分散投资。日常活跃度、各类副本挑战以及限时活动是获取招募券、金币、忍者碎片和培养材料的主要来源。加入一个活跃的组织至关重要，不仅可以参与组织活动获取额外资源，还能通过祈愿系统请求所需的忍者碎片，加速S级忍者的合成与升星。围绕主力S级忍者搭配阵容时，需考虑队伍的整体羁绊效果、属性克制关系以及攻防辅助的平衡，以应对游戏内多样的玩法挑战。
